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Projets de recherche appliquée
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Rapport scientifique du département des technologies
industrielles de l'EIG
Dispositifs et
instrumentation biomédicale et environnementale
Capteur OCT compact
pour le diagnostic médical ou environnemental en temps réel.
L’OCT (Optical Coherence Tomography)
est une technique qui permet d’acquérir des images de tissus biologiques en
temps réel avec une résolution de l’ordre du micromètre. Dans le cadre de ce
projet, l'institut développe un nouveau prototype de capteur optique
miniature, qui englobe toute la partie de traitement optique du signal
jusqu’à sa sortie électrique, pour la mesure localisée en temps réel de
grandeurs physiques dans un échantillon biologique, tels que par exemple
l’épaisseur, l’indice de réfraction, ou l’absorption à différentes longueurs
d’onde. La réalisation de ce capteur optique miniature ouvre la porte à la
conception de nouveaux instruments médicaux portables pour le diagnostic
médical rapide, tels que la biopsie optique, la spectroscopie résolue en
profondeur, ou la mesure du taux d’oxygénation de tissus biologiques en
temps réel. Ces capteurs possèdent un marché potentiellement élevé, car ils
comblent un manque actuel de dispositifs OCT disponibles compact et à faible
coût pour les applications d’imagerie biomédicales non invasives, requises
dans les domaines de l’ophtalmologie, dermatologie, oncologie, etc, ainsi
que pour des applications de surveillance non destructive de processus
biologique dans les végétaux. L'institut contribue également régulièrement à
l’optimisation et au développement de composant et instruments d’optiques
pour les industries et collabore étroitement avec des centres de recherches
nationaux pour l’élaboration de nouveaux dispositifs de diagnostics
(endoscopes OCT). Sur ce thème prioritaire, l'institut est actif également
dans d’autres projets autant pour le domaine médical que pour le domaine
environnemental.
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Bio-information
Système embarqué pour
le diagnostique fonctionnel du cœur en temps réel.
Ce projet se situe dans le domaine de
l'imagerie médicale et de l'aide au diagnostic. Son but est d'analyser en
temps réel la contraction cardiaque à partir d'une séquence d'images IRM,
par l'intermédiaire d'un système de traitement d'images embarqué. Un des
problèmes des séquences d'images IRM est le déplacement du coeur engendré
par la respiration du patient, rendant difficile le diagnostic visuel du
praticien. Des acquisitions en apnée sont réalisables, mais pas souhaitables
due à la dobutamine injectée, qui a pour effet d'accélérer le coeur afin de
mettre en évidence un trouble éventuel de la contraction cardiaque. Le
système développé permet de résoudre ce problème en proposant un recalage
des images successives en temps-réel afin que le praticien puisse se
concentrer sur une même région du coeur. Il permet également, à partir de la
détection des contours de l'endocarde, de quantifier en temps-réel la
fraction d'éjection partielle du coeur. Ce projet fait appel à deux
compétences complémentaires que la MRU possède: les systèmes embarqués et le
traitement d'images. L'institut possède une grande expérience des systèmes
embarqués. Il a participé à d'autres projets ambicieux et possède une forte
expertise en traitement d'images, particulièrement dans le champ biomédical.
Il a en effet participé à de nombreux projets utilisant la segmentation
d'Image - morphologie mathématiques, comme par exemple :
-
projet sur la détection et
l'isolation de tumeurs du cerveau ;
-
projet sur la perfusion cardiaque ;
-
projet de cartographie de grains de
beauté ;

-
etc.
mais aussi :
-
projet de permettant de quanlifier
la qualité de mousses alimentaires ;
-
projet de détection automatique de
questionnaires spéciaux pour personnes andicapées ;
-
projet d'indentication de
caractères d'imprimerie ;
-
etc.
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Technologies innovantes, destinées à la
recherche, au diagnostic et à l’assistance médicale
Orthèse pour
myopathes
Les myopathies sont des maladies
graves et actuellement irréversibles. Il s'agit d'une atrophie musculaire
qui conduit à une paralysie plus ou moins accusée. La maladie va en
s'aggravant avec le temps, ainsi le malade perd peu à peu de son autonomie.
Il est très fréquent que ces personnes aient recours à une chaise roulante
électrique. Ce processus peut être long et très éprouvant pour le malade
ainsi que son entourage.
Les myopathies
sont des dégénérescences des muscles. Ainsi les fibres musculaires atteintes
ne contractent plus suffisamment sous l'effet d'un stimulus électrique
nerveux (on parle du signal Electromyographique ou EMG).
Ainsi
le muscle ne répond plus aux excitations électriques des nerfs malgré que le
système nerveux n'est pas atteint par cette maladie.

L'idée
du projet a consisté à placer des électrodes sur un patient afin qu'un
système électronique puisse interpréter ces stimuli pour commander une
orthèse mécanique.
Depuis plusieurs années, le laboratoire
de systèmes numériques de l'EIG a développé une orthèse pour myopathe en
collaboration avec l'Association Suisse Romande et Italienne contre la
Myopathie (ASRIM).
Des résultats intéressants ont pu être réalisés, tant du
point de vue de la mécanique que de l'électronique (système à DSP et
microcontrôleur).
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Optimisation
et automatisation d'analyses cliniques ainsi que de processus
biologiques
Système de dépose de
microgouttes et développement de procédé pour la miniaturisation
d’immuno-essais de type ELISA
Les immuno-essais de type ELISA sont
une des méthodes d’analyses de plasma humain dont disposent les laboratoires
de chimie cliniques des hôpitaux. Ces analyses sont automatisées et sont
disponibles en permanence. Elles permettent par exemple la détection de
chaînes de troponines, un marqueur de l’infarctus du myocarde. Selon le
nombre d’analyses à accomplir, ou la nature ou le nombre de marqueurs à
identifier avec un volume fini de sang à disposition, il n’est pas rare
(notamment en pédiatrie), d’être limité dans le nombre d’analyses
réalisables qui sont précieuses pour le choix du traitement adéquat à une
pathologie. Dans le cadre de ce projet, l'institut développe une nouvelle
technologie pour miniaturiser ce type d’analyse clinique et permettre la
détection de profils de protéines marqueurs de pathologies spécifiques. Les
technologies impliquées dans ce développement permettent :
- la dépose simultanée de 24
microgouttes de l’ordre du nanolitre basée sur un dispositif
microfluidique verre-silicium, couplé à un actionneur piézoélectrique ;
- le positionnement précis et
rapide des porte-objets sur lesquelles les microgouttes sont déposées ;
- la vision des microgouttes
déposées pour le contrôle de qualité et le repositionnement en cas de
superposition des microgouttes ;
- le contrôle des conditions
environnantes pour l’optimisation des différentes étapes nécessaires à
l’analyse ;
- le contrôle automatique des
points précédents à l’aide d’un ordinateur et d’un logiciel
d’instrumentation ;
- l’optimisation des paramètres
d’analyse avec un petit nombre initial protéines marqueurs.
Dans ce projet, l'institut collabore
avec le Centre Médical Universitaire de Genève. L’implémentation d’un
premier prototype de système de dépose parallèle simultanée sans contact a
permis de réduire considérablement le temps de dépose par rapport aux
techniques de dépose de microarrays classiques. La valorisation de ce projet
concerne potentiellement deux pistes :
- l’accroissement sensible de la
productivité en recherche médicale visant à identifier des marqueurs ou
des profils de marqueurs pour une pathologie précise (p.ex. attaque
cérébrale hémorragique ou ischémique) ;
- l’exploitation de cette
nouvelle approche d’immuno-essais de type ELISA en standard dans les
laboratoires d’analyses cliniques des hôpitaux. Basé sur ce type de
technologies et sur ce thème prioritaire, l'institut est actif également
dans d’autres projets autant pour le domaine médical que pour le domaine
environnemental.

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Mais encore...
A comparison of
two different microbial air monitoring methods.
The inspectors of the FDA (Food and Drug Administration of the USA)
recommend and insist on the necessity to increase the number and the
duration of microbiological air sampling per day or as function of specific
activities. The difference in quality of Petri dishes (thickness, type of
culture medium, rate of drying) influences the efficiency of colony
formation as compared to the actual concentration of micro-organisms in the
air. Human presence during the air sampling (personal contamination) may
also considerably affect the number of colony forming units (CFU). The
present study aims to test different influencing parameters on colony
formation and to compare two different air sampling methods: conventional
and sequential air sampling.
Synthèse d'une molécule
anti-SIDA marquée au C-14

Étude de l’assimilation
d’une hormone de croissance marquée au 14C par des micro boutures de pommier

Etude d'un dispositif
de diagnostic portable

etc.
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